Machine Learning for Better Prognostic Stratification and Driver Gene Identification Using Somatic Copy Number Variations in Anaplastic Oligodendroglioma.

Journal: The oncologist
PMID: 30018130

Abstract

BACKGROUND: 1p/19q-codeleted anaplastic gliomas have variable clinical behavior. We have recently shown that the common 9p21.3 allelic loss is an independent prognostic factor in this tumor type. The aim of this study is to identify less frequent genomic copy number variations (CNVs) with clinical importance that may shed light on molecular oncogenesis of this tumor type.

Authors

  • Shai Rosenberg
    Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, INSERM U1127, CNRS UMR7225, Paris, France shair@hadassah.org.il ahmed.idbaih@aphp.fr.
  • Francois Ducray
    Service de Neuro-Oncologie, Hôpital Neurologique, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France.
  • Agusti Alentorn
    Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, INSERM U1127, CNRS UMR7225, Paris, France.
  • Caroline Dehais
    Service de Neurologie 2-Mazarin, Hôpitaux Universitaires La Pitié Salpêtrière - Charles Foix, AP-HP, Paris, France.
  • Nabila Elarouci
    Programme cartes d'identite des tumeurs, Ligue nationale contre le cancer, Paris, France.
  • Aurelie Kamoun
    Programme cartes d'identite des tumeurs, Ligue nationale contre le cancer, Paris, France.
  • Yannick Marie
    Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, INSERM U1127, CNRS UMR7225, Paris, France.
  • Marie-Laure Tanguy
    Service de Biostatistiques, Hôpitaux Universitaires La Pitié Salpêtrière - Charles Foix, AP-HP, Paris, France.
  • Aurélien De Reynies
    Programme cartes d'identite des tumeurs, Ligue nationale contre le cancer, Paris, France.
  • Karima Mokhtari
    Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, INSERM U1127, CNRS UMR7225, Paris, France.
  • Dominique Figarella-Branger
    Institut de Neurophysiopathologie, team GlioME, Faculte de Medecine, Universite d' Aix-Marseille, Marseille, France.
  • Jean-Yves Delattre
    Sorbonne Université, INSERM U1127, CNRS UMR7225, Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (ICM), AP-HP, Hôpitaux Universitaires La Pitié Salpêtrière - Charles Foix, Service de Neurologie 2-Mazarin, Paris, France.
  • Ahmed Idbaih
    Sorbonne Université, INSERM U1127, CNRS UMR7225, Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (ICM), AP-HP, Hôpitaux Universitaires La Pitié Salpêtrière - Charles Foix, Service de Neurologie 2-Mazarin, Paris, France shair@hadassah.org.il ahmed.idbaih@aphp.fr.

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